Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms