Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spp1P10923 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms