Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prf1P10820 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prf1P10820 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms