Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
P10404 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
P10404 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P10404 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P10404 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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