Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PolP10400 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PolP10400 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PolP10400 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms