Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a2P08122 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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