Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spta1P08032 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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