Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TnfP06804 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TnfP06804 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TnfP06804 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TnfP06804 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TnfP06804 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TnfP06804 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TnfP06804 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TnfP06804 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TnfP06804 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TnfP06804 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TnfP06804 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TnfP06804 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TnfP06804 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TnfP06804 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TnfP06804 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnfP06804 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms