Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-Eb1P04230 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms