Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04214 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04214 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04214 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04214 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04214 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04214 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04214 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04214 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04214 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04214 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P04214 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms