Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01734 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01734 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01734 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01734 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01734 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01734 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01734 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01734 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01734 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01734 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01734 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01734 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01734 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01734 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01734 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms