Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01647 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01647 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01647 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01647 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01647 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01647 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01647 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01647 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01647 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01647 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01647 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01647 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01647 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01647 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms