Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ShdO88834 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShdO88834 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShdO88834 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ShdO88834 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ShdO88834 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ShdO88834 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ShdO88834 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ShdO88834 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ShdO88834 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShdO88834 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShdO88834 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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