Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BlmO88700 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BlmO88700 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BlmO88700 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BlmO88700 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BlmO88700 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BlmO88700 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BlmO88700 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BlmO88700 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BlmO88700 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BlmO88700 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BlmO88700 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BlmO88700 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BlmO88700 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BlmO88700 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BlmO88700 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BlmO88700 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BlmO88700 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BlmO88700 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BlmO88700 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BlmO88700 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BlmO88700 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BlmO88700 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BlmO88700 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BlmO88700 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BlmO88700 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BlmO88700 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BlmO88700 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BlmO88700 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
BlmO88700 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BlmO88700 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BlmO88700 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BlmO88700 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BlmO88700 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BlmO88700 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms