Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

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Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp2O88623 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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