Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dync1i1O88485 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.4 ms