Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AurkcO88445 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AurkcO88445 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms