Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col5a1O88207 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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