Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp4O70480 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms