Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms