Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif6O55135 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms