Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copb2O55029 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copb2O55029 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copb2O55029 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copb2O55029 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copb2O55029 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms