Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc3O55013 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms