Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SlkO54988 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SlkO54988 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SlkO54988 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SlkO54988 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SlkO54988 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SlkO54988 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms