Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DffaO54786 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffaO54786 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffaO54786 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffaO54786 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffaO54786 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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DffaO54786 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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DffaO54786 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffaO54786 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffaO54786 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffaO54786 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffaO54786 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DffaO54786 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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DffaO54786 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffaO54786 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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DffaO54786 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffaO54786 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffaO54786 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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DffaO54786 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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DffaO54786 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffaO54786 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffaO54786 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffaO54786 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffaO54786 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffaO54786 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DffaO54786 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms