Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limk2O54785 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Limk2O54785 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Limk2O54785 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms