Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cavin1O54724 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cavin1O54724 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms