Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rab33bO35963 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms