Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn6O35646 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn6O35646 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn6O35646 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms