Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc27a2O35488 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms