Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema6aO35464 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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