Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Abcc1O35379 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcc1O35379 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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Abcc1O35379 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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Abcc1O35379 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Abcc1O35379 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Abcc1O35379 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Abcc1O35379 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Abcc1O35379 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc1O35379 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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