Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RrhO35214 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RrhO35214 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RrhO35214 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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RrhO35214 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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RrhO35214 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RrhO35214 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RrhO35214 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RrhO35214 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RrhO35214 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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RrhO35214 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RrhO35214 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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RrhO35214 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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