Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pitx3O35160 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx3O35160 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms