Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Polr1aO35134 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr1aO35134 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms