Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nfil3O08750 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms