Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CltaO08585 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltaO08585 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltaO08585 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltaO08585 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltaO08585 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltaO08585 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CltaO08585 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltaO08585 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltaO08585 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltaO08585 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltaO08585 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltaO08585 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltaO08585 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CltaO08585 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CltaO08585 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CltaO08585 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltaO08585 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CltaO08585 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltaO08585 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltaO08585 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltaO08585 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltaO08585 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltaO08585 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltaO08585 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltaO08585 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltaO08585 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltaO08585 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltaO08585 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms