Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms