Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
U90926O08546 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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U90926O08546 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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U90926O08546 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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U90926O08546 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
U90926O08546 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
U90926O08546 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms