Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms