Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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