Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp35M0QWN7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms