Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20878L7N244 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20878L7N244 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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