Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5849J3QPE5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm5849J3QPE5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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