Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm21797J3QNW5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm21797J3QNW5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm21797J3QNW5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21797J3QNW5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21797J3QNW5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21797J3QNW5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21797J3QNW5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21797J3QNW5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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