Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17577J3QNF7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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