Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM8

Gm7971, Predicted gene 16429, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7971J3QMM8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm7971J3QMM8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm7971J3QMM8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm7971J3QMM8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm7971J3QMM8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm7971J3QMM8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm7971J3QMM8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm7971J3QMM8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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