Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm17535J3KMR8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17535J3KMR8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms