Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21863J3KMP8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms