Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn20G5E8X0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn20G5E8X0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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